Да, действительно, почему-то все представляют себе скрещивание половым путем (конечно так понятнее и привычнее), тогда как уже сегодня даже в нашей цивилизации нет проблем получить, к примеру, гибрид человека и розы, т.е. уже давно возможно не только межвидовое скрещивание, дающее плодовитое потомство, но даже между различными царствами. Так что классическое определение вида сильно размылось. Теперь в него нужно добавить: «естественным половым путем».
Что касается признаков, определяемых и наследуемых не на генетическом, а на полевом уровне, то я думаю, что геном является лишь неадекватным отражением неких полевых структур, которые и определяют и сам геном, и направленность мутаций, т.е. более высокую вероятность целесообразных мутаций, см.:
http://lc.kubagro.ru/aidos/aidos06_lec/lec_12.htm